Museum yang terletak di tengah Kota Yogyakarta dengan alamat Jl. Faridan M. Noto No. 21 Kotabaru, Yogyakarta ini sering sekali menerima kunjungan dari beberapa siswa sekolah maupun perguruan tinggi untuk belajar persandian di Indonesia. Berlokasi di daerah Kotabaru yang penuh atmosfer Indis, Museum Sandi menyimpan berbagai benda bersejarah tentang ilmu kriptografi Indonesia.

Museum Sandi terdiri dari dua lantai dengan eksibisi yang berkaitan dengan sejarah persandian di Indonesia. Dikelompokkan ke dalam Ruang Introduksi, Ruang Agresi Militer I, Ruang Agresi Militer II, Ruang Maket Dukuh di Lantai I, Ruang Merdeka, Ruang Nusantara, Ruang Edukasi, Ruang Tokoh, Ruang Sandi Global di Lantai II.

Dahulu Lantai I diperuntukkan sebagai ruang tamu, dilanjutkan dapur, kamar pembantu, gudang. Sekarang pengunjung dapat menikmati video Sejarah Persandian Dunia di Ruang Introduksi, menyimak Buku Code C yaitu buku kode pertama yang dimiliki Indonesia dan ragam koleksi di Ruang Agresi Militer I, serta mengenal perjuangan gerilya petugas sandi di Ruang Agresi Militer II.

Koleksi Museum Sandi berupa barang asli atau replika peralatan sandi, meubeler, sepeda, patung, barang keseharian pelaku sejarah persandian, slide sistem sandi, dokumen lembaran kertas dan buku kode, gambar, foto, peta napak tilas sandi, lukisan kegiatan sandi dalam perundingan, diorama kegiatan kurir sandi dan suasana pedukuhan Dukuh.

Museum Sandi semakin aktif berperan serta dalam kancah permuseuman, baik di tingkat lokal maupun nasional dibuktikan dengan keterlibatan dalam berbagai festival, pameran, seminar, maupun program-program publik yang diselenggarakan Museum Sandi.

Hal ini tidak terlepas dari tugasnya untuk mengelola museum dan melaksanakan edukasi budaya keamanan informasi. Inovasi yang dilakukan Museum Sandi membuahkan hasil diantaranya meraih Anugerah Purwakalagrha dalam ajang Indonesia Museum Award 2016 dengan kategori Smart Museum atau Museum Pintar. Museum Sandi juga menjadi Museum Favorit Pengunjung dalam pameran Museum Goes to Campus 2017 di UNS dan Stand Museum dengan Pelayanan Terbaik pada saat mengikuti pameran ulang tahun Taman Mini Indonesia Indah tahun 2017.

Fasilitas yang terdapat di museum ini antara lain Pemandu, Anjungan Informasi Elektronik, Cryptogames bermedia touchscreen, Ruang Pameran, Ruang Multimedia, Ruang Perawatan Koleksi , Aula, Mushola, Toilet, Halaman Parkir roda dua dan empat

Jam Operasional di Museum Sandi

• Senin - Kamis (08.30 -15.00 WIB)
• Jumat (08.30 - 11.30 WIB)
• Sabtu - Minggu (09.00 - 12.00 WIB)
• Hari besar nasional dan libur agama tutup

Tiket Masuk tidak ada/gratis